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高通量测序技术对早熟棉中miRNA的鉴定与分析
作者:董章辉 朱青竹 赵丽芬 眭书祥 李增书 张艳丽 王虎 郭永召 姚则羊 赵国忠 审核: 上传: 来源: 发布时间:2020/8/19 17:05:03 发布人:admin

棉花中miRNA的数量仍较少,miRNA在棉花早熟发育中的作用有待证明和揭示。为丰富棉花中miRNA的数量,同时,为揭示miRNA在早熟棉发育中的作用,以早熟棉花品种石早1和中熟棉花品种冀棉958为材料,利用高通量测序技术构建了2个小RNA文库,鉴定新的miRNA,比较早熟棉花和中熟棉花中miRNA表达的差异、特点。结果共鉴定到131个miRNA,包括41个不同家族的64个已知miRNA和67个新的miRNA;新miRNA中,54个miRNA属于已知miRNA家族,13个miRNA属于新的miRNA家族。比较2个品种中miRNA表达的差异,共发现39个miRNA在2个品种中的表达差异超过2倍,占总miRNA数的29. 8%,主要为中低量表达的miRNA。15个高表达miRNA中,只有miR398家族的ghr21在2个品种中的表达差异超过2倍(达到3. 4倍);比较相同家族的不同miRNA在两品种中的表达差异,发现相同家族的miRNA在2个品种中表达差异可以不同,推测有不同的生物学功能。揭示了miRNA在早熟棉发育过程中,对其早熟性具有重要作用,为进一步研究miRN... 更多

国家棉花产业技术体系(CARS-15-27); 河北省科技计划项目(16226303D-2); 河北省现代农业产业技术体系(HBCT2018040206);

棉花; miRNA; 高通量测序; 早熟;

S562

 
 
 
 
 

 下载地址:https://kns.cnki.net/KCMS/detail/detail.aspx?dbcode=CJFQ&dbname=CJFDLAST2020&filename=HBNB2019S1003&uid=WEEvREcwSlJHSldTTEYzWEpEZktjY241K2JoVjJOYVRmVUl0eUR5a2ZKcz0=$9A4hF_YAuvQ5obgVAqNKPCYcEjKensW4IQMovwHtwkF4VYPoHbKxJw!!&v=MDYzODg3RGgxVDNxVHJXTTFGckNVUjdxZmIrZG1GeTdrVjd6TkxTL0ZiTEc0SDlpdnJvOUZaNFI4ZVgxTHV4WVM=